NDKmol - molecular viewer 0.97

Лицензии: Бесплатный ‎Размер файла: 688.13 KB
‎Рейтинг пользователей: 3.0/5 - ‎1 ‎Голосов

О NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Молекулярный зритель для Android - О NDKmol является молекулярным зрителем для Android. Вы можете просматривать трехмерные структуры белков, нуклеиновых кислот и малых молекул. NDKmol поддерживает большинство общих представлений для молекул, таких как лента, след, палка, сфера и линия. NDKmol также поддерживает операции симметрии; биологические сборки и кристаллическая упаковка могут быть отображены. Вы можете искать и загружать структуры из RCSB PDB и NCBI Pubchem. NDKmol имеет почти такую же функциональность, как GLmol, которая написана в WebGL/Javascript и работает в веб-браузерах. Вы можете попробовать GLmol в http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html Особенности и особенности Читать файл PDB или SDF/MOL Вращение/перевод/увеличение модели пальцем Представительства - Линия - Палка - Сфера (радиус Ван дер Ваалс) - Альфа углеродный след - Лента (тонкая или толстая) - Странд - B фактор трубки - Нуклеиновой кислотной лестнице - Линия нуклеиновой кислоты - растворители 'звезды' Сглаживание бета-листов Раскраска - По цепочке - По вторичной структуре (когда определено в записях SHEET/HELIX) - По элементам - Градация (также из цепной чаши) - Фактор B - полярные/неполярные Кристаллография - Отображение ячейки блока - Показать кристаллическую упаковку (когда она определена в разделе REMARK) - Отображение биологической сборки (когда определено в разделе REMARK) Как использовать При запусках NDKmol автоматически загружает Porin (PDBID: 2POR) в качестве примера. Молекулу можно повернуть пальцем. Чтобы увеличить или перевести молекулу, нажмите кнопку MENU в телефоне/планшете и выберите режим. Поддерживаются также жесты с двумя пальцами. Все остальное можно сделать из MENU. Чтобы загрузить другие файлы PDB, пожалуйста, поместите файл в каталог SD-карты "PDB" и выберите команду "Open" в MENU. Вы также можете скачать структуры непосредственно с RCSB PDB и NCBI PubChem веб-сервера. Выберите "Поиск и загрузка" в меню. Контактный контакт Сайт проекта расположен по адресу http://webglmol.sourceforge.jp/ . Вы можете получить исходные коды для этой программы отсюда. Комментарии и предложения приветствуются на http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ или [email protected] Уведомление LICENSE NDKmol сама лицензируется в соответствии с GNU Малой общей государственной лицензии следующим образом. Тем не менее, файлы PDB, включенные в качестве примеров, находятся в условиях DIFFERENT. Пожалуйста, проконсультируйтесь http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Молекулярный зритель для Android (C) Авторское право 2011, biochem_fan Эта программа является свободным программным обеспечением: вы можете перераспределить его и / или изменить его в соответствии с условиями GNU Малая общая общественная лицензия, опубликованная Фонд свободного программного обеспечения, либо версия 3 лицензии, или (по вашему выбору) любой более поздней версии. Эта программа распространяется в надежде, что она будет полезна, но БЕЗ ЛЮБОЙ ГАРАНТИИ; даже без подразумеваемой гарантии MERCHANTABILITY или FITNESS ДЛЯ КОНКРЕТНОЙ ЦЕЛИ. Посмотреть GNU Малая общая общественная лицензия для более подробной информации. Вы должны были получить копию GNU Малая общая общественная лицензия